El 26 de agosto de 2025, la OPS emitió una alerta sobre el resurgimiento de la tos ferina en la Región de las Américas y la aparición de cepas resistentes a antibióticos. Entre 2023 y 2025, los casos aumentaron de 4.139 en 2023 a 43.751 en 2024 y a 18.595 con 128 muertes entre enero y julio de 2025, principalmente en lactantes. La cobertura de la vacuna DTP3 cayó durante la pandemia a 81% y aunque se recuperó parcialmente a 88% en 2023, aún no alcanza el 95% recomendado por la OMS. Paralelamente, desde 2024 se detectaron cepas resistentes a macrólidos (azitromicina, claritromicina y eritromicina) en Brasil, Estados Unidos, México y Perú, asociadas a mutaciones en el gen 23S rRNA y al uso indiscriminado de antibióticos durante la pandemia. La OPS subraya que este escenario responde a la combinación de brechas en inmunización, inequidades entre países y resistencia emergente, y recomienda fortalecer la vacunación en niños, embarazadas y personal de salud, reforzar la vigilancia molecular y capacitar a los equipos en resistencia antimicrobiana.

Durante el 2025 (semanas epidemiológicas 1 a 41), a nivel nacional se notificaron en Sivigila 5 929 casos de tos ferina. De estos, el 13,2 % (782 casos) fueron confirmados (772 con procedencia nacional y 10 importados), el 81,3 % (4 822 casos) fueron descartados y el 5,5 % (325 casos) continúa en estudio.

La incidencia nacional fue de 1,46 casos por cada 100 000 habitantes. Al compararla con los registros históricos para la misma semana epidemiológica, se observa un incremento respecto a los años 2017 a 2024, cuando la incidencia no superó los 0,68 casos por cada 100 000 habitantes.

El mayor número de casos se registró en Bogotá D. C. con 260 casos y una incidencia de 3,27 casos por cada 100 000 habitantes, seguido de Antioquia con 177 casos (2,55), Cundinamarca con 50 casos (1,41) y Caldas con 24 casos (2,28).

Hasta la semana epidemiológica 42 se han reportado 2648 casos probables de tos ferina, de los cuales 2402 son procedentes de Bogotá, esto representa 5 veces más el reporte del año anterior (436 casos probables). Se han confirmado 293 casos (11,07%) comparado con 4 casos confirmado en 2024 (11 casos durante todo el año). Del total de casos confirmados, 264 corresponden a residentes de Bogotá, 28 a Cundinamarca y 1 caso de Norte de Santander.  En Bogotá, 165 de los casos se presentan en menores de 5 años, 30 en niños de entre 5 y 14 años y 69 en mayores de 15 años; además, se ha identificado 10 como nexos epidemiológicos.

Por localidad de residencia, los casos confirmados se distribuyen de la siguiente manera: Ciudad Bolívar (40), Kennedy (34), San Cristóbal (27), Suba (26), Usaquén  (23), Usme (22), Engativá (16),  Bosa (15), Rafael Uribe Uribe (13), Fontibón (11), Santafé (10), Los Mártires (9), Teusaquillo (5), Tunjuelito (4), Bogotá sin dirección (3) casos, Chapinero y Puente Aranda cada una con 2 casos y finalmente Antonio Nariño y Barrios Unidos cada una con 1 caso.  Respecto a la mortalidad, se han confirmado 5 casos fatales: 4 en niños menores de un año y 1 caso en un adulto. De estos, dos corresponden a residentes de Usme, uno a Suba, uno a San Cristóbal y uno a Kennedy. Esto representa una tasa de mortalidad de 0,063 casos por 100.000 habitantes y una letalidad del 1,89%. En cuanto a grupos poblacionales se han presentado 9 casos (3,4%) en población migrante y 6 casos (2,2%) en población indígena.